CAMPANARO STEFANO

Contacts
E-mail
8ae036462ae0e97470d5971d401f7a8e
bring this page
with you
Structure Department of Biology
Telephone 0498276306
Qualification Professore associato confermato
Scientific sector BIO/11 - MOLECULAR BIOLOGY
University telephone book  Show
 

Office hours
Complesso Vallisneri 3° piano ala sud lab. n° 16 In genere mi trovate ogni giorno, consigliabile prendere appuntamento via mail o telefonando allo 0498276306
(updated on 24/10/2017 18:06)

Proposals for thesis
At present the main research topic where students can work during the master thesis is metagenomic analysis of the microbial community present in biogas reactors used for methane production (in collaboration with I. Angelidaki of the DTU environment Copenhagen http://www.env.dtu.dk/english/Service/Phonebook/Person?id=4803&tab=1).
Analyses are mainly bioinformatics, for more details see the following paper
https://biotechnologyforbiofuels.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13068-016-0441-1

Curriculum Vitae
Personal web page: https://sites.google.com/site/stefanocampanaro/home

Laurea conseguita presso l’Università di Padova nel luglio del 1998 nel laboratorio del Prof G. Valle con una tesi sulla discriminazione di ceppi di lievito tramite l’analisi dei polimorfismi di microsatelliti.
1999: partecipazione ad un progetto internazionale avente lo scopo di effettuare la delezione di tutti i 6000 geni noti di S. cerevisiae con il fine di ottenere una collezione di ceppi deleti marcati con “codici a barre molecolari” al fine di utilizzarli per l’identificazione di geni implicati in specifici processi biologici tramite i microarrays.
2002: dottorato in biotecnologie nel febbraio 2002 presso l’Università degli studi di Padova nel laboratorio del Prof. G. Valle e G. Lanfranchi con una tesi intitolata “sviluppo di un microarray di geni espressi nel muscolo scheletrico umano e applicazione all’analisi del profilo di espressione di pazienti affetti da disferlinopatia”.
2002-2004: borsa post-dottorato presso il Centro di Biotecnologie del CRIBI dell’Università di Padova nel laboratorio del Prof. G. Valle e G. Lanfranchi sullo studio del profilo di espressione di pazienti LGMD-2B.
2004-2007: analisi genomica e profilo di espressione di P. profundum, un batterio isolato a grande profondita nel Mar di Sulu (Filippine); il progetto è stato condotto in collaborazione col gruppo di Douglas Bartlett (Scripps Institute-San Diego-California) ed ha lo scopo di comprendere gli adattamenti dei batteri in grado di crescere a profondità abissali.
2008: Visiting fellow presso la "University of New South Wales" (Sydney). Ho svolto una collaborazione con Ricardo Cavicchioli dell'UNSW (Sydney, Australia) incentrata sull'adattamento alle basse temperature di Methanococcoides burtonii e Sphingopyxis alaskensis.
2007-2010: Ho recentemente completato l’analisi del profilo trascrizionale del batterio abissale P. profundum SS9 tramite l'utilizzo di tecnologie di sequenziamento di nuova generazione (SOLID).
Nell'ambito dell'analisi genomica di ceppi di lievito enologici sono stato coordinatore del progetto di ricerca di Ateneo (bando 2008) “Caratterizzazione genomica, trascrittomica e analisi dei metaboliti in ceppi di Saccaromyces cerevisiae di rilevante importanza enologica”. Il progetto è svolto in collaborazione con Viviana Corich e Alessio Giacomini del Dip.to di Biotecnologie Agrarie dell'Università di Padova.
Dal gennaio 2006 assunto come ricercatore afferente presso il Dipartimento di Biologia dell’Università degli Studi di Padova.


Research areas
You can find a detailed and updated description of my research activity in my personal website
https://sites.google.com/site/stefanocampanaro/home
https://sites.google.com/site/stefanocampanaro/home/research

Publications
A detailed description of the reasearch activities and an updated list of publications is reported in my personal website
https://sites.google.com/site/stefanocampanaro/home
https://sites.google.com/site/stefanocampanaro/home/publications

Campanaro S*, Treu L*, Kougias PG*, De Francisci D*, Valle G, Angelidaki I. Metagenomic analysis and functional characterization of the biogas microbiome using high throughput shotgun sequencing and a novel binning strategy. Biotechnology for Biofuels. 2016; 9:26.

Treu L, Toniolo C, Nadai C, Sardu A, Giacomini A, Corich V, Campanaro S. The impact of genomic variability on gene expression in environmental Saccharomyces cerevisiae strains. Environ Microbiol.

Campanaro S, De Pascale F, Telatin A, Schiavon R, Bartlett DH, Valle G. The transcriptional landscape of the deep-sea bacterium Photobacterium profundum in both a toxR mutant and its parental strain. BMC Genomics. 2012; 13:567.

De Francisci D, Campanaro S, Kornfeld G, Siddiqui KS, Williams TJ, Ertan H, Treu L, Pilak O, Lauro FM, Harrop SJ, Curmi PM, Cavicchioli R. The RNA polymerase subunits E/F from the Antarctic archaeon Methanococcoides burtonii bind to specific species of mRNA. Environ Microbiol. 2011; 13(8):2039-55.

Campanaro S, Williams TJ, Burg DW, De Francisci D, Treu L, Lauro FM, Cavicchioli R. Temperature-dependent global gene expression in the Antarctic archaeon Methanococcoides burtonii. Environ Microbiol. 2011; 13(8):2018-38.

Campanaro S, Treu L, Valle G. Protein evolution in deep sea bacteria: an analysis of amino acids substitution rates. BMC Evol Biol. 2008; 8:313.

Vitulo N, Vezzi A, Romualdi C, Campanaro S, Valle G. A global gene evolution analysis on Vibrionaceae family using phylogenetic profile. BMC Bioinformatics 2007; 8 (Suppl 1):S23. (IF 3.617)

Simonato F, Campanaro S, Lauro FM, Vezzi A, D'Angelo M, Vitulo N, Valle G, Bartlett DH. Piezophilic adaptation: a genomic point of view. J Biotechnol. 2006;126(1):11-25. Review. (IF 2.600)

Forner F, Foster LJ, Campanaro S, Valle G, Mann M. Quantitative proteomic comparison of rat mitochondria from muscle, heart, and liver. Mol Cell Proteomics. 2006; 5(4):608-19. (IF 9.620)

Campanaro S, Vezzi A, Vitulo N, Lauro FM, D'Angelo M, Simonato F, Cestaro A, Malacrida G, Bertoloni G, Valle G, Bartlett DH. Laterally transferred elements and high pressure adaptation in Photobacterium profundumstrains. BMC Genomics. 2005; 14;6:122. (IF 4.092)

Vezzi A, Campanaro S, D’Angelo M, Simonato F, Vitulo N, Lauro F M, Cestaro A, Malacrida G, Simionati B, Cannata N, Romualdi C, Bartlett D H and Valle G. Life at depth: Photobacterium profundum genome sequence and expression analysis. Science 2005; 307 (5714): 1459-61. (IF 30.927)

Campanaro S, De Pitta C, Celegato B, Millino C, Romualdi C, Pacchioni B, Trevisan S, Bellin M, Cagnin S, Tombolan L, Fanin M, Pegoraro E, Te Kronnie G, Pescatori M, Valle G, Basso G, Ricci E, Angelini C and Lanfranchi G. Application of a cDNA microarray for the analysis of muscular dystrophies and childhood leukemias. Minerva Biotec. 2003; 15 (4): 235-44. (IF 0.304)

Giaever G, Chu AM, Ni L, Connelly C, Riles L, Veronneau S, Dow S, Lucau-Danila A, Anderson K, Andre B, Arkin AP, Astromoff A, El-Bakkoury M, Bangham R, Benito R, Brachat S, Campanaro S, et al. Functional profiling of the Saccharomyces cerevisiaegenome. Nature. 2002; 418 (6896):387-91. (IF 30.432)

Lecturer's Publications (PDF): 8AE036462AE0E97470D5971D401F7A8E.pdf

List of taught course units in A.Y. 2019/20
Degree course code (?) Degree course track Course unit code Course unit name Credits Year Period Lang. Teacher in charge
SC1166 COMMON SCP4068162   ITA STEFANO CAMPANARO
»   SCP4068163 7 3rd Year (2019/20) First
semester
ITA GABRIELLA MARGHERITA MAZZOTTA
»   SCP4068164 7 3rd Year (2019/20) First
semester
ITA STEFANO CAMPANARO
SC2445 005PD SCP9087942 6 2nd Year (2019/20) First
semester
ENG STEFANO CAMPANARO